Investigadores del RCM ganan premio en bioinformática

Un grupo de investigadores, encabezado por el doctor Ricardo González Méndez, catedrático de la Escuela de Medicina del Recinto de Ciencias Médicas (RCM) de la Universidad de Puerto Rico (UPR) reveló que los estudiantes de minoría que estudian biología en universidades que sirven poblaciones minoritarias de la nación necesitan mayor preparación en informática.

La investigación fue reconocida como el Mejor Artículo (“Best Paper”) en Diversidad y Desarrollo en la Fuerza Trabajadora en Computación, durante la Conferencia Anual del Extreme Science and Engineering Discovery Environment 2016 (XSEDE16) celebrada en Miami, Florida.

“A través de la investigación y el perfil de los estudiantes que participaron en un internado de verano trabajando en bioinformática usando sistemas de alta capacidad, lo que se conoce como supercomputadoras, desciframos que los estudiantes de biología provenientes de universidades de minorías no dominan efectivamente el campo de la informática. De hecho, alrededor del 50 al 70% expresó que solo tenían destrezas de principiantes o básicas en áreas de bioinformática y que entre el 68 y 91% expresó tener el nivel de principiante o básico en áreas de genómica y computación”, expuso el doctor Ricardo González, uno de los investigadores principales del proyecto, en un comunicado de prensa.

El estudio, desarrollado mediante una colaboración entre la UPR y el Centro de Supercomputadoras de Pittsburgh, evidenció que el bajo dominio técnico del uso de la informática le impide al estudiante convertirse en un científico competitivo del campo de la bioinformática y la genómica y le crea dificultades en el procesamiento y análisis de este tipo de datos. También reduce el acceso a grandes recursos de datos y las posibilidades de formar a una mayor cantidad de estudiosos de la evolución y el origen de los genomas y su aplicación a las ciencias biomédicas.

El estudio de la información genética que poseen los organismos y las especies es una de las disciplinas más vanguardistas de la biología y de la medicina hoy en día.

“Es importante que la comunidad científica y académica conozca este dato y se reconozca la importancia de elevar los conocimientos de estos estudiantes en el campo de la informática; específicamente en esta época en la que predomina la tecnología”, dijo el doctor González.

El estudio recomienda que esta disparidad social en la educación de bioinformática y métodos cuantitativos debe ser atendida para asegurar que los investigadores de minoría puedan dirigir cuestionamientos científicos utilizando la tecnología computacional más innovadora. Esto incluye reformas a los currículos en biología, más mentoría académica y de investigación en estas áreas, y nuevos programas subvencionados para entrenar científicos en estas especialidades.

Perfiles de Estudiantes que recibieron PhDs del RCM, egresados del programa de internado en bioinformática el Pittsburgh Supercomputing Center:

• Emilee Colón – PhD en Microbiología, Escuela de Medicina UPR – realizó trabajos en evolución de proteínas en malaria y desarrollo de compuestos como posibles tratamientos usando bioinformática. Publicó su trabajo a nivel internacional y sus resultados produjeron un ‘grant’ del Fideicomiso de Ciencia y Tecnología para su mentora la doctora Adelfa Serrano. Trabaja como Científica Postdoctoral con la doctora Serrano en el Recinto de Ciencias Médicas.
• Teresa Martínez – PhD en Microbiología, Escuela de Medicina UPR – secuenció, ensambló y analizó los genomas de dos clonos de la bacteria Acinetobacter baumanii aisladas en hospitales en Puerto Rico. Tiene varias publicaciones sobre estos trabajos en revistas nacionales e internacionales junto a su mentora, la doctora Iraida Robledo. Comenzó su trabajo como Científica Postdoctoral en el State University of New York en Stonybrook bajo el doctor Tom MacCarthy.
• María Rodríguez – PhD en Bioquímica, Escuela de Medicina UPR – realizó trabajos en evolución, caracterización y estructura de proteínas de bacterias para la producción ácidos grasos tipo EPA. Tiene varias publicaciones sobre estos trabajos en revistas nacionales e internacionales junto a su mentor, el doctor Abel Baerga. Actualmente trabaja en la compañía Eli Lilly en Puerto Rico.

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